Compound



Pubchem Compound ID File upload

化合物検索は、各PCIデータベースの化合物ID、化合物名および、PubChem Compoundデータベース 中の同じ構造式の化合物を検索できるようになっています。


検索方法

Step 0.外部サイトでの検索

pubchem_structure

部分構造検索など複雑な検索をしたい場合は、PubChem Structure Search をご利用ください。検索結果をUI Listフォーマットでファイル保存すれば、 Pubchem Compound IDのファイルが作成されます。他のツールで検索した場合も、 Pubchem Compound IDが各行の最初の単語であれば、ご利用いただけます。


Step 1.検索

compound

上部のCompound Searchボックスに、DragBank ID (DrugCard entry no.)、 CTD chemical ID (MeSH)、ChENBL compound ID、PubChem Compound ID のうち1つを入力してください。完全一致する化合物を検索します。 それに加え、化合物名に含まれる単語で前方一致するものを検索します。 ただし前方一致検索の場合、3文字以下の単語は検索できません。

Compound ID ファイルを入力したい場合は、Pubchem Compound ID File upload をご利用ください。


Step 2.検索結果一覧

compound_summary

検索した化合物の一覧が表示されます。タンパク質-化合物相互作用のデータがあるものは、PCIの欄に数字があります。 表示したいタンパク質のPCI欄の数字をクリックしてください。


Step 3.PCIデータ

pci_compound

選択した化合物と相互作用のあるタンパク質が表示されます。


PCI DB is licensed under Creative Commons licenses.


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